iGEM个人学习背景介绍

大家好,我是来自大陆普高的一名高三留学生。我的初中和高中都是在公立学校就读(高中就读于国际部),大学即将赴约翰霍普金斯就读本科。我的专业方向主要是生物和化学。初中我有幸接触到国内的生物竞赛,到高中也开始参加各类国际生化比赛和活动,所以我目前对生化领域还是有一定的了解和感悟的。

iGEM是我高一高二参加的一门科研类竞赛,作为队伍中的建模组长,我和队员们一起拿到了全球金奖、最佳建模提名、最佳人类实践提名的好成绩。

自己选择参加iGEM竞赛的原因&竞赛含金量

今天在这里我想跟大家分享的国际比赛是iGEM国际基因工程学大赛(International Genetically Engineered Machine)。这个比赛是一个周期很长的科研类竞赛。参赛者以队伍为单位,需要在十个月左右的时间内通过基因工程技术解决一项问题,以试验结果及其分析展现你的解决方案和成效。作为一个学习生物化学的学生,iGEM给我带来了很珍贵的科研经历,拓展了我的学科知识,也锻炼了我的团队合作能力。

因为iGEM需要我们真正进入实验室做基因工程的实验,这是我参加比赛之前从来没有体验过的。在参赛的几个月中,我阅读了大量英文文献,学习了很多的实验知识,亲身体验了大学的科研流程和科研氛围,也亲自接触了很多很有科研经验的大学生、研究生、博士生。这些在实验室的经历告诉了我很多关于学习生物的未来职业规划,也让我的申请简历有话可说。

此外,因为iGEM是一个大项目,所以需要频繁地和不同的老师、同学、甚至是甲方沟通。作为组长,我需要组织会议、分配任务。这对于高一刚进入国际体系的我来说很有挑战性,但是也很好地锻炼了我的沟通能力和领导能力。总的来说,iGEM是一个提升学生综合素质的比赛(在你比赛不划水的前提下)。

抛开个人的比赛经历不谈,iGEM本身就是一个在国际上享有盛名的合成生物学竞赛。它最初由麻省理工学院MIT)创办,高中生、本科生、研究生的队伍均可以参加(但是分开竞争)。优秀的项目研究成果会发布于《Economists》《Science》《Scientific American》等前沿杂志。所以,一个iGEM的好奖项放在简历上,对大学录取一定是有很大帮助的。

下面我就将结合自己的亲身经历来为大家详细介绍一番这个比赛。

iGEM比赛设置

iGEM比赛有三个奖项类别,高中生、本科生、研究生分开竞争。

Grand Prize

Grand Prize是iGEM竞赛的最高奖项,每年参赛队伍的第一名为Grand Prize,第二名为First-Runner Up。

Special Prize

Special Prize是针对项目每个部分的评奖,含金量第二高。评委会提名出在某个项目上表现很好的组别,它们会被评为nomination for best xxx,之后再在这些提名中挑选出最好的,评为best xxx。2022年一共有16项special prize,如建模、人类实践、实验、网页制作…

Gold Medal, Silver Medal, Bronze Medal

金银铜牌奖的获奖标准在赛季开始前会由组委会发给参赛队伍,只要队伍当年的项目内容达到了评奖标准,队伍就会得到该奖项。每年通常有百分之四五十的队伍获得金奖。

iGEM比赛任务

这张图是iGEM官方给出的比赛流程图。因为这是一个很主观的比赛,所以每个队伍的进度都不一致,我在这里大致给大家介绍一下每个阶段的具体任务和注意事项。

具体任务

iGEM比赛持续时间大致为每年的二月到十一月,根据不同的目标可以分为三个阶段:项目准备阶段、项目实施阶段、项目包装阶段。比赛对于基础知识的要求每个组不一样,比如实验组就要求有合成生物学的理论和实验能力,建模组和网站组要求有一定的数学能力和html网页搭建能力,其他如社会实践组要求的主要是学生的综合素质,如沟通能力、规划能力等。不过这些基础知识都不能算作iGEM的门槛,因为它们上手难度不高,同学们完全可以现学现用。

二月到五月是准备阶段,学生组队完成后会进行选题、分工、熟悉比赛细则、制定实验计划等准备工作。头脑风暴和定题是本阶段最重要的任务,需要队员阅读大量英文文献,分组调研,推荐大家从三月就开始准备。实验计划建议从五月中旬开始制作,也要求实验组的同学阅读大量文献。除此之外,同学可以在此期间学习一些合成生物学相关的理论和实验知识,为后续的正式实验节约时间。

六月到八月是主要的计划实施期,工作量很大。不过这段时间国内学生放暑假,所以可以投入更多时间。在这个期间,实验要着手开始做,同时围绕实验进行的建模和社会实践也要根据计划实施。因为大部分队伍都是第一次做实验,所以失误在所难免。参赛的同学们一定要早开始做实验,并且做好deadline前还在实验室测数据的心理准备。

重要工作

我再来说说这段时期除了实验的iGEM重要工作吧。在iGEM中,实验以外的parts一定是为实验服务的。首先是建模,建模的目的通常是让实验数据更加有意义/帮助确定实验方向;社会实践通常是调查整个创新项目在社会上的意义/收集反馈;硬件设计是包装试验结果,把项目产品可视化的部分;网页制作旨在给评委呈现小组的整个项目(最后评委是根据每个队伍制作的网页以及最终答辩来给项目评分的),所以它也算是决定最终项目评分的重要部分。网页如果没能够及时开始做,ddl前没有把项目完整地呈现在网页上,最后评分也是会偏低的。

最后九月到十一月是项目的最后包装期和答辩期。当所有项目都在ddl前提交之后,就要开始准备项目答辩。iGEM的答辩相对比较简单,评委提的问题不会特别刁钻,学生做到充分了解自己的项目的优缺点就可以很好地对答了。疫情期间答辩是在线上进行的,从2023年开始,所有队伍将会在十月聚集在同一地点进行线下答辩。

iGEM需要了解的内容/避开的坑

对于想参加iGEM比赛的同学,有几个问题大家一定要提前思考。

首先就是花费问题。因为iGEM需要分子生物学实验室及实验材料,也需要各种类型的社会资源,所以很多队伍会选择签约比赛代理机构,它们通常会提供比赛相关资源场地以及指导老师。不过目前市面上的机构价格较高,预算低的同学可能需要仔细考虑。如果不签机构,同学们就需要自己向学校/亲戚朋友找场地和资源,比赛指导老师也需要自行联系。

此外,iGEM是一个很花时间的竞赛,并且你的收获和你投入的时间成正比。如果在比赛过程中积极参与到每一项工作中,你一定会收获很多科研知识和经验的。

iGEM比赛特点

iGEM是综合性强,含金量高,备赛时间长的科研竞赛。

iGEM涉及了众多专业的内容,从很多方面培养学生的综合素质:生物化学的同学负责项目主要实验,数学计算机的同学负责建模和网页搭建,艺术设计的同学负责视频、海报制作和各类美工,社科的同学负责项目运营和社会调研…因此,其实无论是什么专业,都可以在iGEM这个比赛中找到自己的闪光点。

含金量我刚刚也提到了,它是很有知名度的国际性比赛,如果同学们做的好的话,还能拿这个项目去发表论文抑或是投稿参加其他竞赛。

最后,iGEM赛季从二月一直持续到十一月,队员们需要从零开始完成一项完整的科研项目,备赛周期尤为漫长。

iGEM准备该项竞赛时用到的材料/网址/学习资源

iGEM中有用的网址可以分为以下几类:

官网:https://igem.org/

官网上包含了比赛相关的所有信息,也包括了历年参赛队伍的项目信息。对于第一次参赛的选手来说,多翻看以往的获奖项目和评奖标准非常有利于上手iGEM这个比赛。此外,最终的网站制作是要通过官网上的特殊渠道进行的。

文献资料查询

👉1.谷歌学术:

https://scholar.google.com/

谷歌学术是覆盖所有学科范围的文献查询网站,可以查到大部分英文文献。

👉2.PubMed:

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/

PubMed是一个专门针对生物学相关文献的搜索引擎。因为iGEM的实验部分与合成生物学相关,所以大部分实验相关的文献都是从这个网站上找的。

👉3.National Center for Biotechnology Information (NCBI):

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/

这个网站是查询各类型分子生物学信息的渠道,这些信息包括但不限于大部分已知蛋白质、DNA、RNA的序列和结构分析。

👉4.Sci-Hub:

https://sci-hub.st/

Sci-Hub可以通过每篇已发表文献的DOI码来下载文献的pdf。因为很多文献在官网上需要付费才能阅读,所以sci-hub对于想查阅文献的高中生来说非常有用。

各类线上沟通软件

因为iGEM需要5-15人的队伍长期合作,并且产出种类繁多,所以借助市面上的线上工作软件来组织工作是非常有必要的。钉钉、飞书、腾讯文档之类的程序大家都要积极利用。

最后,祝所有参加iGEM的同学们实验一遍过,答辩不出错!

福利时刻

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